Spatial proteomics of Euglena gracilis with a focus on its pellicle structure and chloroplast protein import
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-07277S
Alternative language
Project name in Czech
Prostorová proteomika Euglena gracilis se zaměřením na strukturu pelikuly a import do chloroplastu
Annotation in Czech
Výzkum krásnoočka Euglena gracilis dosáhl nedávno několika milníků, kdy sekvenování transkriptomu a částečného genomu následované proteomickými studiemi chloroplastu, mitochondrie a bičíku pomohlo vytvořit jasnější obraz o dějích v buňce. V tomto projektu plánujeme vykreslit ještě přesnější a kompletnější proteinovou mapu jeho buněk pomocí prostorové proteomiky (LOPIT), která se ukázala k tomuto účelu velmi užitečná v případě výtrusovce Toxoplasma gondii a bičíkovce Paratrimastix pyriformis. Získaná data se stanou cenným zdrojem pro budoucí výzkum tohoto organismu. V navazujících experimentech s využitím in-situ značení pomocí CRISPR-Cas9 a RNAi knock-downů se pokusíme ověřit roli vybraných proteinů účastnících se endomembránové dráhy přenášející proteiny na membrány chloroplastu a přes jeho obal. Dalším systémem, který bychom rádi prozkoumali pomocí prostorových proteomických dat, je pelikula, komplikovaná struktura podpírající buněčný povrch krásnoočka a zodpovědná za jeho specifický pohyb, jehož princip dosud není znám.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - another secondary branch
10606 - Microbiology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
10,422 thou. CZK
Public financial support
10,422 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK