All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”
7F16007

Methodology development in mass spectrometry- based proteomics

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

    EEA/Norwegian Financial Mechanism

  • Call for proposals

    Finanční mechanismy EHP/Norsko 2 (SMSM20167F001)

  • Main participants

    Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    MSMT-35776/2016-1

Alternative language

  • Project name in Czech

    Vývoj metodologie pro výzkum proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie

  • Annotation in Czech

    Top-down proteomika je metoda identifikace proteinů, která využívá hmotnostní spektrometrii pro analýzu intaktních proteinů. Stanovení přesných hmot intaktních proteinů je významný informační přínos pro identifikaci proteinových species pocházejících z aminokyselinových modifikací, genových variant, variacích v transkripci, štěpení signálních peptidů a posttranslačních modifikací. Jedná se o poměrně nový a rozvíjející se přístup v porovnání s bottom-up proteomikou. Přes nedávný vývoj, existují v metodice top-down proteomiky stále rezervy pokud jde o detekci pomocí hmotnostní spektrometrie, bioinformatického zpracování dat, kvantifikaci a separaci proteinů. V rámci tohoto projektu se zaměříme na vysokoúčinné metody pro separaci proteinů, především na zkoumání potenciálu kapilární elektroforézy ve spojení s hmotnostní spektrometrií pomocí nově vyvinutého rozhraní. Podpora mobility umožní vytvoření efektivního komunikačního prostředí mezi českým a norským výzkumným týmem. Cílem aktivity je definování aktuálních potřeb a výzev v proteomickém výzkumu a ověření perspektiv nově vyvíjených technologií pro analýzu komplexních proteomických problémů pomocí MS. Zapojení českých doktorandů ve formě studijních pobytů na partnerském pracovišti přispěje k jejich profesnímu rozvoji a umožní výměnu poznatků a zkušeností v oblasti proteomiky, což považujeme za významný přínos této aktivity. Závěrem budou na základě získaných výsledků formulovány perspektivy další spolupráce mezi týmy.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CC - Organic chemistry

  • CEP - secondary branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The project succeeded by the assignment, i.e. the project objectives and its expected results in the project contract were met.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Nov 14, 2016

  • Realization period - end

    Apr 30, 2017

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Jan 30, 2017

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP18-MSM-7F-U/05:1

  • Data delivery date

    Nov 21, 2018

Finance

  • Total approved costs

    242 thou. CZK

  • Public financial support

    242 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK