Methodology development in mass spectrometry- based proteomics
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
EEA/Norwegian Financial Mechanism
Call for proposals
Finanční mechanismy EHP/Norsko 2 (SMSM20167F001)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-35776/2016-1
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj metodologie pro výzkum proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie
Annotation in Czech
Top-down proteomika je metoda identifikace proteinů, která využívá hmotnostní spektrometrii pro analýzu intaktních proteinů. Stanovení přesných hmot intaktních proteinů je významný informační přínos pro identifikaci proteinových species pocházejících z aminokyselinových modifikací, genových variant, variacích v transkripci, štěpení signálních peptidů a posttranslačních modifikací. Jedná se o poměrně nový a rozvíjející se přístup v porovnání s bottom-up proteomikou. Přes nedávný vývoj, existují v metodice top-down proteomiky stále rezervy pokud jde o detekci pomocí hmotnostní spektrometrie, bioinformatického zpracování dat, kvantifikaci a separaci proteinů. V rámci tohoto projektu se zaměříme na vysokoúčinné metody pro separaci proteinů, především na zkoumání potenciálu kapilární elektroforézy ve spojení s hmotnostní spektrometrií pomocí nově vyvinutého rozhraní. Podpora mobility umožní vytvoření efektivního komunikačního prostředí mezi českým a norským výzkumným týmem. Cílem aktivity je definování aktuálních potřeb a výzev v proteomickém výzkumu a ověření perspektiv nově vyvíjených technologií pro analýzu komplexních proteomických problémů pomocí MS. Zapojení českých doktorandů ve formě studijních pobytů na partnerském pracovišti přispěje k jejich profesnímu rozvoji a umožní výměnu poznatků a zkušeností v oblasti proteomiky, což považujeme za významný přínos této aktivity. Závěrem budou na základě získaných výsledků formulovány perspektivy další spolupráce mezi týmy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CC - Organic chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project succeeded by the assignment, i.e. the project objectives and its expected results in the project contract were met.
Solution timeline
Realization period - beginning
Nov 14, 2016
Realization period - end
Apr 30, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jan 30, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-7F-U/05:1
Data delivery date
Nov 21, 2018
Finance
Total approved costs
242 thou. CZK
Public financial support
242 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK