Comprehensive top-down-bottom-up proteomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-07581S
Alternative language
Project name in Czech
Vícerozměrná proteomická analýza proteinů a peptidů
Annotation in Czech
V proteomické analýze se využívají dva přístupy charakterizace proteinů: analýza nativních proteinů, případně jejich zpětná charakterizace pomocí analýzy peptidů vzniklých proteolytickým štěpením původních proteinů. Zatímco přímá analýza proteinů s sebou přináší problémy v hmotnostně spektrometrické detekci, více rozšířená analýza peptidů ne vždy poskytuje dostatečné informace o nativní struktuře jednotlivých proteinů. V rámci tohoto projektu je navržen vývoj experimentálního uspořádání dvourozměrné kapalinové chromatografie, které kombinuje oba dva zmíněné přístupy. V první dimenzi dochází k separaci nativních proteinů, které jsou následně podrobeny online proteolýze a vzniklé peptidy jsou rozděleny v druhé separační dimenzi. Projekt navrhuje přípravu kapilárních kolon s monolitickými stacionárními fázemi, jejichž porézní struktura bude cíleně upravena pro získání požadovaných separačních vlastností v analýze jak proteinů, tak i peptidů. Výsledky získané z navrženého uspořádání umožní podrobnější studium proteinů, jejich struktuře a funkci v různých biologických systémech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
4,764 thou. CZK
Public financial support
4,764 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK