Tumors with no aspartate synthesis: a metabolic mystery
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-10167S
Alternative language
Project name in Czech
Nádory bez syntézy aspartátu: metabolická záhada
Annotation in Czech
Aspartát! Mělo se za to, že je jasné, jak rakovinné buňky vytvářejí tuto aminokyselinu nezbytnou pro jejich proliferaci a růst nádorů. Je známo, že dva enzymy, transaminázy GOT1 a GOT2, produkují aspartát endogenně. Zjistili jsme však, že růst rakovinných buněk B16 a nádorů melanomu není narušen kombinovaným deficitem GOT1/2 (GOT1/2 dKO), což bylo potvrzeno u dalších 2 modelů, a že tyto buňky nezískávají aspartát z prostředí pomocí transportérů, makropinocytózou nebo recyklací. Předpokládám, že nádorové buňky mohou ke kompenzaci ztráty GOT1/2 využívat dosud neznámou dráhu syntézy aspartátu. Pro její identifikaci budeme zkoumat buňky GOT1/2 dKO pomocí multi-omics, provedeme scRNAseq v nádorech, abychom odhalili adaptace při ztrátě GOT1/2 in vivo, a použijeme metabolické značení C13 k odhalení zdrojů aspartátu. Pomocí negativního CRISPR screenu odhalíme funkční závislosti GOT1/2 dKO buněk a validujeme nejlepší kandidáty. Tento výzkum umožní identifikovat alternativní cesty syntézy aspartátu, což posune naše chápání a nasměruje nové terapeutické koncepty v metabolismu rakoviny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
10,233 thou. CZK
Public financial support
10,233 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK