Causes and consequences of the recombination rate evolution in eukaryotic lineages differing in chromosome type
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-11400S
Alternative language
Project name in Czech
Příčiny a důsledky evoluce frekvence rekombinace u eukaryotických linií lišících se typem chromozomů
Annotation in Czech
Ačkoli rekombinace poskytuje sexuálním eukaryotům jasnou výhodu oproti asexuálům, pochopení toho, jak různá rekombinační rate (RR) ovlivňuje velikost ekologické niky druhů, je pro evoluční biology stále velkou výzvou. Touto otázka bude jádrem naší ústřední hypotézy. Jelikož odhad RR pomocí rekombinačního mapování nelze použít na velkých časoprostorových/fylogenetických škálách, překonáme toto omezení využitím unikátního modelu – druhů s holocentrickými chromozomy (bez lokalizované centromery), jejichž RR je primárně určen počtem chromozomů. Využijeme stovky tisíc snímků z Evropského vegetačního archivu ke stanovení vlivu RR na šířku niky u stovek modelových druhů. Dále pomocí bioinformatické analýzy NGS sekvenovaného repeatomu (>100 druhů) a cytogenomiky odhalíme, zda fragmentace chromozomů usnadňuje odstraňování transpozonů prostřednictvím ektopické rekombinace, čímž objasníme dlouhodobý paradox negativní korelace mezi počtem chromozomů a genomem u druhů s holocentrickými chromozomy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 6, 2024
Finance
Total approved costs
9,480 thou. CZK
Public financial support
9,480 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK