Boosting incoherent quantitative phase imaging by implementing 3D-image reconstruction
Project goals
Holographic incoherent-source quantitative phase imaging (hiQPI) is a modern imaging technique with a potential to become an important tool for biomedical applications: it comprises the key qualities of microscopy, holography and light-scattering techniques, therefore enables label-free imaging and biomass-distribution measurement of living cells with high contrast. This project aims to perfect hiQPI by building 3D-image reconstruction modality into the existing systems, without significant modifications of their setups. To meet this objective, we will develop methods inspired by z-stacking and holographic tomography. Then, we will develop a 3D image-reconstruction algorithm, arising from propagation-based approaches and using machine learning to achieve rapid global-minimum convergence, and implement necessary hardware. Finally, we will employ the achieved 3D hiQPI system for imaging and biomass-distribution measurement of biological experiments. The project outcomes will include novel description of imaging and light propagation in hiQPI devices and 3D image-reconstruction methods.
Keywords
Digital holographyHolographic microscopyQuantitative phase imagingThree-dimensional imagingPartial coherenceCell imagingCytometryTissue imaging
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta strojního inženýrství
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-12283S
Alternative language
Project name in Czech
Posílení nekoherentního kvantitativního fázového zobrazování zavedením rekonstrukce trojrozměrného obrazu
Annotation in Czech
Holografické kvantitativní fázové zobrazování s nekoherentním zdrojem světla (hiQPI) je moderní zobrazovací technika s potenciálem stát se důležitým nástrojem pro biomedicínské aplikace: zahrnuje klíčové vlastnosti mikroskopie, holografie a technik založených na rozptylu světla. Proto umožňuje zobrazovat bez použití barviv a měřit rozložení biomasy živých buněk s vysokým kontrastem. Tento projekt si klade za cíl zdokonalit hiQPI tím, že do stávajících systémů zabudujeme modalitu pro 3D zobrazování, a to bez výrazných úprav jejich konstrukce. Abychom tento cíl splnili, vyvineme metody inspirované použitím z-stacků a holografické tomografie. Poté vyvineme algoritmus pro rekonstrukci 3D obrazu, vycházející z přístupů založených na propagaci svazků a využívající strojového učení k dosažení rychlé globální konvergence, a také implementujeme potřebný hardware. Nakonec využijeme tohoto 3D hiQPI systému pro zobrazování a měření distribuce biomasy biologických vzorků. Výstupy projektu budou zahrnovat nový popis zobrazování a šíření světla v hiQPI systémech a metody 3D rekonstrukce obrazu.
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
5,860 thou. CZK
Public financial support
5,658 thou. CZK
Other public sources
202 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
5 860 CZK thou.
Public support
5 658 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Optics (including laser optics and quantum optics)
Solution period
01. 01. 2024 - 31. 12. 2026