Driver or hitchhiker? The role of horizontal gene transfer in the climate adaptation of a wild Hordeum species
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-15192S
Alternative language
Project name in Czech
Řídit, nebo se jen vézt? Role horizontálního přenosu genů v klimatické adaptaci divokého ječmene (Hordeum)
Annotation in Czech
Horizontální přenos genů (HGT) je důležitým evolučním mechanismem u vyšších rostlin. Plané ječmeny (Hordeum, Pooideae) ze sekce Stenostachys získaly prostřednictvím HGT z prosa (Panicum, Panicoideae) sadu genů kódujících proteiny. Tyto geny souvisejí s reakcí rostlin na stresové podmínky, ale jejich přesná funkce u ječmenů není známa. Naše předběžné analýzy naznačují souvislost přítomnosti těchto genů u ječmenů s teplotními charakteristikami prostředí, a tedy možnou roli v klimatické adaptaci. Cílem projektu je odhalit klimaticky podmíněnou genetickou variabilitu u modelového druhu H. pusillum a posoudit roli cizorodých genů původem z prosa v této adaptaci. Rostliny z klimaticky různorodých populací budou resekvenovány a mapovány na referenční genom. Bude zkoumána mezipopulační genetická variabilita ve vztahu ke klimatickým proměnným, čímž budou identifikovány geny (jak původní, tak získané prostřednictvím HGT), které jsou základem klimatické adaptace. Úloha genů spojených s adaptací na klima bude ověřena pomocí růstových experimentů a analýz genové exprese.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Apr 7, 2025
Finance
Total approved costs
9,968 thou. CZK
Public financial support
9,968 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK