Heterolobosea as a model group for studying the role of horizontal gene transfer in anaerobic eukaryotic lineages
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
SGA0202000002
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-16549Y
Alternative language
Project name in Czech
Heterolobosea jako modelová skupina při studiu role horizontálního genového přenosu v evoluci anaerobních linií eukaryot
Annotation in Czech
Horizontální genový transfer (HGT) zahrnuje přenos genů mezi nepříbuznými organismy. Recentní studie naznačují, že HGT je důležitým zdrojem evolučních novinek u eukaryot, kterým usnadňuje adaptaci na život v nových prostředích. Význam HGT v eukaryotické evoluci a v evoluci anaerobního způsobu života je nicméně stále předmětem vzrušených debat. Navrhovaný projekt se zaměřuje na roli a dopad HGT s využitím skupiny Heterolobosea jako modelu. Příslušníci této skupiny jsou geneticky i morfologicky značně diverzifikovaní a obývají celou škálu prostředí včetně anoxických sedimentů, útrob živočichů, hypersalinních habitatů a termálních pramenů. Pomocí analýzy transkriptomických a genomických dat ze zástupců všech hlavních linií této skupiny budou identifikovány případy HGT původem z prokaryot i eukaryot. Původ těchto událostí pak bude interpretován v kontextu rekonstruované fylogeneze celé skupiny. Bude určen počet HGT u heteroloboseí s důrazem na geny uplatňující se v anaerobióze a následně bude porovnán význam genů získaných HGT s těmi, které byly zděděny od společného předka.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Jun 30, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GJ-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
5,355 thou. CZK
Public financial support
5,295 thou. CZK
Other public sources
60 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK