Mechanisms of growth and survival in freshwater oligotrophs (MEGASO)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-15813S
Alternative language
Project name in Czech
Růstové vlastnosti a schopnosti přežívání sladkovodních oligotrofních bakterií (MEGASO)
Annotation in Czech
Proč jsou ve sladkovodních jezerech pomalu rostoucí oligotrofní bakterie početnější než rychle se dělící kopiotrofové? K zodpovězení této dlouhotrvající otázky využijeme izolované kultury a studium mikrobiálních populací in situ. Systematicky budeme porovnávat kmeny ze tří modelových oligotrofních rodů (‘Ca. Fonsibacter’, ‘Ca. Planktophila’, ‘Ca. Methylopumilus’) s meso- a kopiotrofními kmeny z naší rozsáhlé sbírky na základě genetických a růstových charakteristik. Laboratorní pokusy kombinované s diurnálními a sezónními metatranskriptomickými daty odhalí růstové limitace a in situ exprese genů pomůže identifikovat základní mechanismy úspěchu oligotrofů v jezerech. Zaměříme se na roli rodopsinů, všeobecnou strategii a benefity využívání světelné energie, monitorováním sezonních i denních změn, experimenty a analýzou koexprese. Nakonec se budeme v cílených experimentech zabývat jedním z hlavních faktorů mortality sladkovodních mikroorganismů s cílem vyřešit dlouhodobou hádanku, jestli jsou oligotrofní bakterie méně zranitelní spásáním prvoky než kopiotrofní.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
10618 - Ecology
OECD FORD - another secondary branch
10617 - Marine biology, freshwater biology, limnology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
DA - Hydrology and limnology<br>EE - Microbiology, virology<br>EH - Ecology - communities
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 25, 2025
Finance
Total approved costs
15,997 thou. CZK
Public financial support
15,997 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK