Understanding the evolution of amphizoic organisms: genomic basis and metabolic potential of organisms capable of living freely and inside hosts
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-17373S
Alternative language
Project name in Czech
Porozumění evoluci amfizoických organismů: genomický základ a metabolický potenciál organismů schopných žít volně i uvnitř hostitelů
Annotation in Czech
Diplomonády jsou jednobuněční eukaryotičtí bičíkovci známí především jako endobionti metazoí a parazité obratlovců. Skupina zahrnuje i volně žijící zástupce, kteří unikli endobiotickému způsobu života druhotně díky tomu, že získali dříve ztracené geny prostřednictvím laterálního přenosu genů. Hexamita inflata je mezi volně žijícími diplomonádami jedinečná svou schopností prospívat ve velmi kontrastních podmínkách (volně v sedimentech či jako endobiont pijavky koňské). Takto ekologicky flexibilní druhy, označované jako amfizoické, jsou v přírodě vzácné. Cílem našeho projektu bude porozumět genomickému pozadí, diferenciální genové expresi i úrovni a směru toku genů mezi ekologicky odlišnými populacemi H. inflata. Využijeme moderních transkriptomických přístupů i sekvenování celých genomů na reprezentativním vzorku populací získaných z pijavic a sedimentů vodních ploch, a současně dat z experimentálně založených laboratorních kultur. To nám umožní detailně popsat genomickou a metabolickou flexibilitu, díky které může jediný organismus prosperovat ve velmi kontrastním prostředí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10613 - Zoology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EG - Zoology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 25, 2025
Finance
Total approved costs
10,233 thou. CZK
Public financial support
10,233 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK