Metabolomics toolkit for polar compounds developed using mouse-microbiota models
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-17543S
Alternative language
Project name in Czech
Metabolomické nástroje pro polární látky vyvinuté s využitím modelů myší mikrobioty
Annotation in Czech
V tomto projektu propojíme expertízy dvou laboratoří a využijeme metabolomiky a gnotobiotických modelů ke studiu interakcí mezi hostitelem a mikrobiotou. Naším cílem bude vyhodnotit řadu technik založených na HILIC a chemické derivatizaci ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií za použití knihovny více než 1 000 polárních metabolitů. Hodnocení bude zahrnovat použitelnost metod pro tři typy biologických vzorků – stolici, moč a sérum – a jejich schopnost separovat v kombinaci s iontovou mobilitou izomery. Dále prověříme navržený koncept molekulárního síťování dle přítomnosti funkčních skupin na základě komparace fragmentačních spekter derivatizovaných metabolitů. Výstupem projektu bude sada nástrojů pro metabolomiku polárních látek vhodných ke studiu vztahů mezi střevní mikrobiotou, stravou a metabolismem hostitele. Užitečnost metod vyhodnotíme jejich aplikací v cílených i necílených metabolomických analýzách za účelem rozlišení skupin myší s odlišnou mikrobiální kolonizací, čímž přispějeme k porozumění interakcí mezi hostitelem a mikrobiotou.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 5, 2025
Finance
Total approved costs
9,814 thou. CZK
Public financial support
9,814 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK