Molecular diagnostic, epidemiology and classification of pathogenic Gram positive cocci
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární diagnostika, epidemiologie a klasifikace klinicky významných grampozitivních koků
Annotation in Czech
Grampozitivní koky reprezentují fylogeneticky heterogenní skupinu bakterií s vysokou fenotypovou rozmanitostí jednotlivých druhů, která znesnadňuje jejich identifikaci. V projektu budou studovány patogenní druhy a kmeny izolované z humánního klinického materiálu, zejména mléčné bakterie ze sepsí (rody Leuconostoc a Pediococcus, které jsou přirozeně vankomycin rezistentní), dále o meticilin rezistentní kmeny Staphylococcus aureus z nozokomiálních infekcí a multirezistentní kmeny Staphylococcus sciuri z humánních infekcí (přírodní rezervoár mecA genu pro rezistenci k meticilinu). Hlavním cílem projektu je vývoj a aplikace moderních metod analýzy genomu a jejich využití pro rychlou a spolehlivou diagnostiku těchto patogenů a jejich molekulární typizaci. Izoláty budou charakterizovány též fenotypizací a celkovým buněčným proteinovým profilem. Detailní taxonomická klasifikace (sekvencování genu 16S rDNA, chemotaxonomie) především mléčných bakterií a skupiny S.sciuri vytváří reálný předpoklad pro
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This project aimed at molecular identification, epidemiology and classification of clinically important Gram-positive cocci. During the first year of the project the collecting of bacterial strains and phenotype and genotype variability analysis (PCR amp
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
4,820 thou. CZK
Public financial support
3,508 thou. CZK
Other public sources
1,312 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK