Genome-based diagnostics and typing of coagulase-negative staphylococci from human clinical specimens
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Genotypová diagnostika a typizace klinicky významných koaguláza negativních stafylokoků
Annotation in Czech
Cílem projektu je aplikace metod analýzy genomu na nejčastěji se vyskytující koaguláza negativní druhy stafylokoků izolovaných z klinického materiálu humánního původu, u nichž není dosud genotypová diagnostika zavedena. Jako objekt studia budou zvoleny zejména kmeny druhu Staphylococcus hominis. Pozornost bude věnována i multirezistentním kmenům druhů S. epidermidis a S. haemolyticus. Budou použity metody pro DNA fingerprinting jako je PFGE, AP-PCR, rep-PCR, ribotypizace, studium plazmidů, aj. Výsledkanalýzy budou korelovány se standardními fenotypovými testy a fagotypizací. Jelikož u S. hominis byl popsán nový poddruh S. hominis subsp. novobiosepticus, bude provedena jeho podrobná genetická charakterizace. Kmeny tohoto poddruhu jsou multirezistentníkantibiotikům a vyskytují se zejména v hemokulturách. Navrhovaný projekt odpovídá současnému celosvětovému trendu v diagnostice patogenních bakterií, které způsobují závažné epidemiologické problémy. Jeho význam spočívá v účinné pomoci klinické praxi a
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Řešení projektu proběhlo v plném souladu s jednotlivými záměry projektu a v návaznosti na nosný projekt. Všechny výsledky jsou adekvátně popsány řešitelem v závěrečné kartě. Výstupy z grantu (spoluautorství): 1 práce publikovaná a 1 přijatá do mezinárodn
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Data delivery date
Apr 1, 2003
Finance
Total approved costs
945 thou. CZK
Public financial support
424 thou. CZK
Other public sources
1,521 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK