Computer analysis of microsatellite expansion in the human genome.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Počítačová analýza prodlužování mikrosatelitů v lidském genomu
Annotation in Czech
V eukaryontních genomech se nacházejí statisíce mikrosatelitních sekvencí, jejichž prodloužení nad kritickou hranici vede v některých případech k závažným onemocněním. V tomto projektu budeme počítačovými metodami analyzovat nukleotidové sekvence uloženév databázi EMBL s cílem nalézt odpovědi na tyto otázky: (i) Prodlužují se všechny mikrosatelity nebo existují mikrosatelity, které se neprodlužují? (ii) Je odpověď na předchozí otázku závislá na typu organismu? (iii) Pokud existují mikrosatelity, které se neprodlužují, jaké jejich vlastnosti je odlišují od mikrosatelitů, které se prodlužují? (iv) Nacházejí se mikrosatelity v nějakém vztahu ke genetické mapě genomu? (v) Jak mikrosatelity přecházejí v okolní genomovou DNA a jaké jsou charakteristiky přechodových oblastí? Nalezení odpovědí na tyto otázky přispěje k pochopení příčin a mechanismů vzniku délkové polymorfie mikrosatelitů a možná i okolností, za kterých dochází k jejich patologickému prodlužování.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Závěrečná zpráva je napsána dostatečně obsáhlou formou, je pečlivá a má všechny náležitosti. U přiložených publikací nechybí údaj o podpoře GA ČR. Badatelský záměr splnil všechny předepsané cíle. Na základě tří doložených publikací jsou výstupy řešení ho
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1997
Realization period - end
Jan 1, 1998
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,046 thou. CZK
Public financial support
821 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK