Caenorhabditis elegans as a model organism for the study of inherited metabolic diseases
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Caenorhabditis elegans jako modelový organismus pro studium dědičných metabolických onemocnění
Annotation in Czech
Z našich předběžných výsledků vyplývá, že jak funkce tak i struktura lysosomálních proteinů a proteiinů, které se podílí na metabolismu metioninu a folátu, je u člověka a C.elegans dobře konzervována. K výhodám C.elegans jako ověřeného modelového organismu patří kompletní znalost genomové sekvence a detailně popsaná buněčná struktura. Za použití techniky RNA interference, která dovoluje ihibovat funkci genu s jednoduchostí nesrovanatelnou s jinými modelovými organismy, budeme vyřazovat klíčové geny výšeuvedených metabolických cest a vytvoříme tak modely lysosomálních onemocnění a poruch metabolismu metioninu, včetně klinciky významné homocysteinurie. Vytvořené modelové organismy budeme detailně analyzovat na úrovni morfologické, biochemické agenetické, za pomoci optické a elektronové mikroskopie, biochemických stanovení proteinu a/nebo metabolitů a analýzy změn genové exprese pomocí DNA čipů. Bioinformatické nástroje použijeme k vyhledávání ortologních a paralogních sekvencí v genomu
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main goal of the project was to evaluate the usefulness of C.elegans model for the study of inherite metabolic disorders. We have employed RNA interference and a range of molecular, morphological and biochemical techniques for study of orthologs of s
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
2,836 thou. CZK
Public financial support
2,836 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK