Nuclear topology of cell genome
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Topologická analýza 3D organizace genomu v interfázovém jádře
Annotation in Czech
Cílem předloženého projektu je prokázat existenci topologických vzorů 3D organizace genomu v interefázových jádrech lidských a myších fibroblastů. Pomocí 3D FISH a 3D ZOO-FISH s lidskými a myšími centromerními a chromosom-specifickými painting probami, 3konfokální mikroskopie a matematických metod analýzy prostorového rozložení bodových a 3D náhodných procesů chceme analyzovat jadernou topologii vybraného souboru ortologních a chromosomálních úseků lidského a myšího genomu v jádrech lidských a myších fibroblastů s cílem ověřit hypothesu o nenáhodné 3D organizaci chromosomů v interfázovém jádře jako projevu evolučně konzervovaného algoritmů 3D organizace genomu v interfázovém jádře.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Projekt si klade za cíl prokázat nenáhodné 3D uspořádání genomu v interfázovém jádře v lidských a myších buňkách, s využitím experimentálních přístupů (FISH, kontakt. mikroskopie) i matematických metod analýzy. Pomocí anti-aktinové protilátky byl prokáz
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
4,729 thou. CZK
Public financial support
2,309 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
3,630 thou. CZK