Morphogenesis of the genome during early embryonic development of C. elegans
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P302-11-1262
Alternative language
Project name in Czech
Morfogeneze genomu v raných vývojových stádiích C. elegans
Annotation in Czech
Morfogeneze genomu je proces, jímž se skládá v buněčném jádře lineárně uložená genetická informace do komplexního trojrozměrného uspořádání. Předpokládáme, že k tomuto skládání dochází reprodukovatelně během vývoje a diferenciace buňky. Tato hypotéza bude testována analýzou prostorového rozmístění vzájemně regulovaných chromozomálních ložisek v raném embryu C.elegans. To představuje ideální model pro tento účel díky invariantnímu rodokmenu C. elegans a synchronnímu vývoji jednotlivých embryí. Prostorovérozmístění genů v jádře embryonální buňky C. elegans bude určeno v živých buňkách vícebarevnou 3D DNA FISH. Získaná data budou analyzována algoritmy pro rozpoznávání vzorů. Vývojová signifikance charakteru genového rozmístění bude zkoumána pomocí dobředefinovaného ?cell fate? mutanta glp-1/Notch. Nalezení reprodukovatelných typů genového uspořádání v průběhu rané embryogeneze by otevřelo nové cesty výzkumu organizace genomu a genové regulace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aims of the project have been fulfilled and allowed to create tools for the study of spatial arrangement of nuclear chromatin in early embryo of C. elegans. The results were published in Plos One and Methods Mol Biol. Other results were published 1 journal and submitted to BMC Dev Biology.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 19, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,910 thou. CZK
Public financial support
5,910 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK