Genes influencing limb patterning: morphology and functional genomics of hypodactyly and polydactyly-luxate mutations in the Norway rat
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
304/06/0116
Alternative language
Project name in Czech
Mutace ovlivňující vývoj končetin: morfologie a funkční genomika hypodaktylní a polydaktylní mutace u potkana
Annotation in Czech
Spontánní mutace modelových organismů jsou významnými prostředky pro odhalování funkcí genů a objasnění genetických mechanismů,které řídívývoj savců. V rámci této výzkumné problematiky plánujeme provedení detailní morfologické a vývojové analýzy mutací způsobujících končetinové malformace laboratorního potkana - hypodaktylii (hd) a polydaktylii-luxaci (Lx). Dále navrhujeme funkčně genomickou analýzu úlohy studovaných mutací ve vývoji stavby končetin pomocí profilování exprese jejich genových produktů vevyvíjejících se končetinových pupenech a posléze vysledování účinku mutantních alel na cílové geny zapojené do vývoje končetiny. Následující krok zahrnuje pokus o nápravu defektů působených mutacemi hd a Lx metodou transgeneze, která by umožnila prokázat kauzální vztah těchto dvou mutací k pozorovaným patologickým fenotypům. V případě úspěchu by bylo možné odhalit nové aspekty signální kaskády vývoje končetiny včetně interakcí mezi geny a mezi geny a prostředím (např. farmakogenetické
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Aim of this project was molecular identification of two developmental mutations in the rat, hypodactyly (hd) and polydactyly-luxate (Lx). We refined the chromosomal position of Lx to 155 kb, identified a candidate gene, transcription factor promyelocytic
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
4,826 thou. CZK
Public financial support
4,772 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
80 thou. CZK