Genes influencing limb patterning: morphology and functional genomics of hypodactyly and polydactyly-luxate mutations in the Norway rat
Project goals
Spontaneous mutations in model organisms were proven as important tools for uncovering gene function and dissecting the genetic networks controlling mammalian development. As a contribution to these efforts, we plan to undertake detail morphological anddevelopmental analysis of mutations causing limb malformations - hypodactyly (hd) and polydactyly-luxate (Lx) - in the laboratory rat. Further on, functional genomic search for the role of the studied mutations in limb patterning is proposed, by the means of: expression profiling of their gene products ondeveloping embryo limb buds and follow-up of the impact of mutant alleles on their natural downstream targets. Next, we propose an attempt to complement the defects caused by the hd and Lx mutationsby the transgenic rescue approach in order to prove the causal relation of the two mutations to the observed pathological phenotypes. If successful, this investigation may uncover novel facets of the signaling cascades in limb patterning, together with
Keywords
limb patterningexperimental models of limb malformationspontaneous mutationsexpression profili
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
304/06/0116
Alternative language
Project name in Czech
Mutace ovlivňující vývoj končetin: morfologie a funkční genomika hypodaktylní a polydaktylní mutace u potkana
Annotation in Czech
Spontánní mutace modelových organismů jsou významnými prostředky pro odhalování funkcí genů a objasnění genetických mechanismů,které řídívývoj savců. V rámci této výzkumné problematiky plánujeme provedení detailní morfologické a vývojové analýzy mutací způsobujících končetinové malformace laboratorního potkana - hypodaktylii (hd) a polydaktylii-luxaci (Lx). Dále navrhujeme funkčně genomickou analýzu úlohy studovaných mutací ve vývoji stavby končetin pomocí profilování exprese jejich genových produktů vevyvíjejících se končetinových pupenech a posléze vysledování účinku mutantních alel na cílové geny zapojené do vývoje končetiny. Následující krok zahrnuje pokus o nápravu defektů působených mutacemi hd a Lx metodou transgeneze, která by umožnila prokázat kauzální vztah těchto dvou mutací k pozorovaným patologickým fenotypům. V případě úspěchu by bylo možné odhalit nové aspekty signální kaskády vývoje končetiny včetně interakcí mezi geny a mezi geny a prostředím (např. farmakogenetické
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Aim of this project was molecular identification of two developmental mutations in the rat, hypodactyly (hd) and polydactyly-luxate (Lx). We refined the chromosomal position of Lx to 155 kb, identified a candidate gene, transcription factor promyelocytic
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
4,826 thou. CZK
Public financial support
4,772 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
80 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 826 CZK thou.
Public support
4 772 CZK thou.
98%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EA - Morphology and cytology
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008