Mapping of the colicin route to the sensitive and immune bacterium: studies on colicin-receptor and colicin-immunity protein interaction
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem
Annotation in Czech
Koliciny jsou toxické exoproteiny produkované některými kmeny čeledi Enterobacteriaceae. Vysoce specifické interakce kolicinového proteinu s komponentami bakteriálního obalu podmiňují vysokou (téměř absolutní) letální účinnost a specifitu těchto molekul.Snadná detegovatelnost kolicinového účinku na citlivé bakterie předurčuje kolicinový výzkum jako modelový pro studium interakce proteinů s komponenty bakteriální buňky. Navrhujeme studovat interakci kolicinu U s receptorovým proteinem OmpA. OmpA receptormá oproti jiným proteinům zevní membrány řadu výhod: jeho krystalová struktura je známa, je přítomen v monomerní formě, 170 N-terminálních aminokyselinových zbytků kóduje transmembránovou část proteinu a mutantní OmpA proteiny s delecí každé ze čtyřindividuálních extracelulárních kliček byly zkonstruovány. Cílem projektu je identifikace aminokyselinových zbytků OmpA proteinu a kolicinu U, které spolu navzájem interagují a definice vazebných epitopů. Dále navrhujeme studovat interakci imunitního
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Interaction sites of OmpA protein, colicins U and Y and their cognate immunity proteins (Cui and Cyi, respectively) were mapped.Three amino acid residues that interact with colicin U molecule were identified in the receptor protein OmpA: I45 (localized i
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
2,857 thou. CZK
Public financial support
2,857 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK