Hypoxia response in the pathogenic yeast Cryptococcus neoformans
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
310/06/0645
Alternative language
Project name in Czech
Odpověď na hypoxii u patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans
Annotation in Czech
Nedávno byla u obligátně aerobní patogenní kvasinky Cryptococcus neoformans popsána unikátní odpověď na hypoxii. Když při omezeném provzdušňování klesne v kultuře koncentrace kyslíku, kvasinka posouvá začátek pučení do G2-fáze, která se postupně prodlužuje, což nakonec vede k zastavení cyklu v podobě velkých nepučících G2-buněk. Budeme připravovat náhodné mutanty a vyhledávat u nich odchylky od hypoxického fenotypu výchozího kmene. Vybrané mutanty budeme podrobně charakterizovat a vhodné mutantytransformovat genomovou knihovnou z výchozího kmene. U transformantů budeme vyhledávat reverzi mutantního fenotypu a slibné kandidáty budeme podrobněji charakterizovat. Budeme sekvencovat komplementující inzerty, identifikovat otevřené čtecí rámce (geny)a homologní sekvence v databázích. Budeme připravovat deleční mutanty pro ověření a charakterizaci funkce těchto genů. Hlavním očekávaným výsledkem je identifikace některých klíčových komponent kryptokokové reakce na hypoxii. Lepší pochopení mechanismu
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
One new component of C. neoformans hypoxia response has been identified, namely the gene CNAG_00156.2 coding for a transcription factor. Based on results of sequence analysis in silico and phenotypic analysis we conclude this factor to represent cryptoco
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
3,102 thou. CZK
Public financial support
2,844 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
387 thou. CZK