Epigenetic regulation of gene expression in transgenic and endogenous loci of higher plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Epigenetická regulace genové exprese v transgenních a endogenních lokusech vyšších rostlin
Annotation in Czech
Rostlinné transgeny často oproti teoretickým předpokladům vykazují sníženou expresi v důsledku epigenetických modifikací (například metylace DNA), což negativně ovlivňuje aplikaci geneticky modifikovaných rostlin v zemědělství a biotechnologiích. Asociace mezi metylační modifikací DNA a umlčováním genové exprese byla ověřená na mnoha živočišných i rostlinných modelech. V předkládaném projektu navrhujeme provést hlubší analýzu našeho původního pozorování - šíření metylace DNA v posttranskripčně umlčenémtransgenním lokusu Nicotiana tabacum v průběhu kulivace buněk in vitro. Na modelových transgenních liniích budou zkoumány vývojové, genetické a evoluční aspekty tohoto fenoménu. Bude sledován vliv epigenetických modifikací na expresi reporterového genu pro bakteriální neomycinfosfotransferázu. Linie obsahující epimutované alely transgenu budou dále podrobeny analýze z hlediska schopnosti induktoru umlčovat expresi homologního lokusu in trans. Budou hledány paralely v epigenetickém
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In the nucleus, transgene loci may interact with each other and as well as with endogenous genes of a host organism. As a result of these interactions there is a hardly predictable expression of genetic traits critical for application of transgene techno
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
2,998 thou. CZK
Public financial support
2,998 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK