Dynamic changes of mitochondrial DNA and transcription profiles in Silene vulgaris
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
521-09-0261
Alternative language
Project name in Czech
Dynamika mitochondriální DNA a polymorfismus transkripčních profilů u Silene vulgaris
Annotation in Czech
Silenka obecná je modelem pro destabilizaci mitochondriálního (mtch) genomu. Tato destabilizace se vyskytuje i u některých linií zemědělských plodin. Plánujeme studovat podrobněji vysoký vnitrodruhového polymorfismu struktury mtch genomu a transkripčníchprofilů mtch genů u silenky obecné. Naše cíly jsou následující - analyzovat souvislost mez polymorfismem mtch DNA a polymorfismem mtch transkripčních profilů, prozkoumat případnou rozdílnost v editování mRNA mezi haplotypy a pomocí kvantitativní PCR porovnat poměr kopiií jednotlivých mtch genů s hladinami odpovídajících mtch transkriptů zejména u heteroplazmických jedinců silenky obecné.Geny MSH1 and RECA3 jsou u Arabidopsis thaliana odpovědny za rekombinaci a replikaci mtch DNA. Plánujeme proto nalézt jejich homologa u silenky obecné a stanovit úroveň jejich exprese v různých vývojových stadiích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution resulted in a number of results in the field of mitochondrial genome variability. Results were published or accepted for publication in 4 WoS journals which are markedly exceed median of the category (New Phytol., PLoS One, BMC Plant Biol., Plant Mol. Biol.), and further in a Czech refereed journal and book chapter.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
2,290 thou. CZK
Public financial support
2,290 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK