Molecular variability of Potato Virus Y (PVY) isolates
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, s.r.o.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární variabilita izolátů viru Y bramboru (PVY)
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt si klade za cíl detailní studium genetické proměnlivosti viru Y bramboru (PVY) s použitím kombinace několika molekulárně genetických metod, zejména specifické amplifikace cDNA pomocí RT-PCR, analýzy virových cDNA pomocí gelové elektroforézy v teplotních gradientech (TGGE), analýzy polymorfismu restrikčních fragmentů (RFLP) a sekvenční analýzy úseků cDNA. Pro tento účel bude vytvořena representativní sbírka izolátů viru, které budou charakterizovány pomocí biologických a sérologickýchmetod. Tento komplexní přístup pak umožní sledovat jednak celkové rozlišení kmenů a izolátů PVY i proměnlivost na úrovni jednotlivých izolátů, včetně přítomnosti tzv. kvaziforem viru. Projekt dále předpokládá, že toto studium povede k výběrspecifických konzervovaných nebo variabilních úseků virového genomu, zejména v rámci genů P1, Nib, CP a CI, které umožní rozlišit jednotlivé molekulární varianty a podskupiny viru. Projekt předpokládá i vývoj nového postupu pro přesnější praktickou
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Projekt byl zaměřen na studium genetické variability Y viru bramboru (PVY). Analýzou oblastí P1, HC-Pro, P3 a Nib genomu, byly objeveny geneticky variabilní populace PVY, pravděpodobně velmi významné z evolučního hlediska. Tak detailní a přesná genetická
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
4,196 thou. CZK
Public financial support
3,241 thou. CZK
Other public sources
1,483 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK