Charakterization of immunochemical variability of various isolates of potato virus y causing potato tuber necrosis ringspot disease (PVY NTN)

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Charakterizace imunochemické variability různých izolátů Y viru bramboru nekrotických pro hlízy bramboru /potato tuber necrosis ringspot disease, PVY NTN/

Annotation in Czech

Ačkoliv je virus bramboru (PVY) jedním z nejdéle popsaných potyvirů, není doposud uspokojivě vyřešena klasifikace a charakterizace jednotlivých izolátů a jejich místo v kmenovém spektru tohoto viru. Podstatou projektu je charakterizace imunochemické variability různých izolátů kmene (PVY)N pomocí molekulárně biologických metod a analýzy struktury obalového proteinu (PVY)N.Určení sekvence nukleotidových fragmentů z N-koncové části obalového proteinu amplifikované pomocí metody reverzní transkripce a polymerázové řetězové reakce (RT PCR) bude využito pro srovnávací studii a klasifikaci různých českých a zahraničních izolátů (PVY)N, vyvolávajících potato tuber ringspot necrosis disease (PVY)NTN. Sekvence aminokyseliny odvozená od nukleotidových sekvencí poslouží pro syntézu determinant a pro další imunochemickou analýzu (PVY)NTN. Imunochemická analýza bude založena na reaktivitě polyklonálních a monoklonálních protilátek s intaktními částicemi (PVY)NTN s degradovaným proteinovým obalem a dále s

R&D category

—

CEP classification - main branch

EE - Microbiology, virology

CEP - secondary branch

EI - Biotechnology and bionics

CEP - another secondary branch

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Provider evaluation

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Project results evaluation

Záměr práce charakterizovat izoláty kmene PVY NTN byl splněn. Zvláště cenné je získání souboru standardních, biologicky charakterizovaných tuzemských izolátů PVY NTN. Stanovení sekvencí N-koncové části genomu odpovídající genu pro plášťová protein a přil

Realization period - beginning

Jan 1, 1998

Realization period - end

Jan 1, 2000

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4

Data delivery date

—

Total approved costs

4,170 thou. CZK

Public financial support

3,106 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK