Molecular biological characterisation, detection and functional analysis of potato mop-top virus (PMTV)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Molekulárně biologická charakterizace, detekce a funkční analýza mop-top viru bramboru (PMTV)
Annotation in Czech
Podstatou předkládaného projektu je bližší charakterizace molekulárně biologických vlastností mop-top viru bramboru (PMTV). Na základě kompletní nukleotidové a aminokyselinové sekvence vybraných izolátů PMTV bude provedena predikce 3D struktury a fylogenetická analýza PMTV izolátů. Dále bude vypracována detekční metoda založená na RT PCR za použití příměrů ze všech tři genomových RNA, čímž bude umožněna spolehlivější detekce a klasifikace izolátů tohoto patogenu. Studium interakcí protein-proteina protein-RNA umožní bližší charakterizaci molekulárně biologických vlastností PMTV a napomůže k lepšímu porozumění a tím i ke kontrole tohoto ekonomicky důležitého patogenu. Informace získané řešením projektu rozšíří základní znalosti genetiky rostlinných virůa tím umožní i účinnou ochranu proti těmto parazitům.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of this study was to extend the knowledge concerning the relations between biological properties and genome sequences of Potato mop-top virus (PMTV). Based on complete sequential and phylogenetic analysis of four Danish and two partial Czech PMT
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
3,176 thou. CZK
Public financial support
3,176 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK