Analysis of Radish mosaic virus (Comovirus) genome
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
522/07/0053
Alternative language
Project name in Czech
Analýza genomu viru mozaiky ředkvičky (Comovirus)
Annotation in Czech
Na našem pracovišti byla v minulosti vytvořena unikátní sbírka více než 20 světových izolátů Viru mozaiky ředkvičky (RaMV). Virus je ekonomicky významným patogenem brukvovitých plodin. Je jedním z posledních celosvětově rozšířených comovirů, u kterého není známa sekvence genomu. Navrhujeme zjistit kompletní sekvenci genomu tohoto viru. Chceme analyzovat variability obou kapsidových proteinů a provést korelaci sekvenčních dat s výsledky našich předchozích sérologických analýz a údaji o okruhu hostitelských rostlin viru. Sekvenční analýzou několika míst genomu u řady izolátů RaMV chceme prokázat hypotézu o rekombinantním původu některých izolátů. Zanalyzujeme a identifikujeme nový comovirus z vodnice izolovaný v USA, a porovnáme jej s RaMV. Přínosem projektu bude významný pokrok v poznání genomu zkoumaného viru, fylogenetických vztahů v rodu a na RaMV jako modelovém viru popíšeme evolučně významné oblasti genomu comovirů. Podobná zevrubná analýza dosud nebyla provedena u žádného jiného
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
2,313 thou. CZK
Public financial support
2,313 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK