Genetic resistance to infectious disease: use of genomics for dissecting mechanisms of innate immunity in the horse
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Veterinární univerzita Brno / Fakulta veterinárního lékařství
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Genetická resistence k infekčním chorobám: využití genomiky ke studiu mechanismů přirozené imunity u koně
Annotation in Czech
Cílem projektu je analýza mechanismů genetické resistence k infekčním nemocem u koně. Jako modelová situace byly vybrána resistence k intracelulárním baktériím a mechanismy přirozené imunity. K tomuto účelu je využíváno principů strukturální a funkční genomiky. Na základě současných znalostí o přirozené imunitě proti intracelulárním nebo fakultativně intracelulárním baktériím byly identifikovány kandidátní geny, které jsou potenciálně významné v genetickém řízení aktivace makrofágů. Tyto geny budou identifikovány a analyzovány z hlediska existence promotorového polymorfismu (strukturální genomika) a jejich exprese na úrovni RNA (funkční genomika). Následně bude studován význam genetického polymorfismu ve vztahu k expresi vybraných genů účastnících se procesů resistence k intracelulárním baktériím in vitro a in vivo u koně a ve vztahu k průběhu infekce in vivo. Pozornost se soustředí na geny exprimované v aktivovaných makrofázích a na geny, které hrají úlohu v TH1 buněčné odpovědi a její regulaci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
40203 - Husbandry<br>40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Immunity-related horse genes were identified, FISH mapped and investigated for the presence of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and/or polymorphic microsatellites. The following genes were selected for analysis: ELA-DQA, TNFR1, TNFR2, IFNG, TFRC, I
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
3,640 thou. CZK
Public financial support
3,640 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK