Immunity-related genes in Equids: genetic diversity and comparative genomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
523/06/1402
Alternative language
Project name in Czech
Geny imunitní odpovědi čeledi Equidae: genetická diversita a komparativní genomika
Annotation in Czech
Ke studiu genetické diversity byly vybrány populace adaptované na podmínky prostředí s výskytem vybraných patogenů: plemeno Murgese a Camargueský kůň. Populace budou srovnány navzájem a diversitou kontrolních kladrubských běloušů. Srovnání vychází z předpokladu, že u každé populace se ustavila specifická genetická diversita související s resistencí k enzootickým patogenům. Bude analyzován polymorfismus ve známých IR genech a budou identifikovány další geny. Na komparativním základě budou vytipovány genyhrající úlohu v klíčových mechanismech regulace imunity a pomocí zoo-primerů budou identifikovány, analyzovány na výskyt SNPs a na základě další charakteristiky budou mapovány metodou FISH. Druhý přístup bude založen na analýze asociací mikrosatelitů adalších markerů s nemocemi (West Nile, ehrlichiosis, piroplasmosis, melanom), identifikaci a mapování kandidátních genů typu I. U zeber a oslů držených v zoologických zahradách v ČR a u divokých zeber bude zkoumána metodami komparativní
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
CEP - secondary branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
40203 - Husbandry<br>40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In agreement with the aims of ther project, analysis of genetic diversity of three model horse populations (Old Kladruber, Camargue and Murgese) was performed. 50 microsatellites, along with SNP immunity-related (IR) gene markers were used for this purpo
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
3,764 thou. CZK
Public financial support
3,764 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK