Analysis of differentially expresed genes in pig fetal skeletal muscles
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Analýza diferenčně exprimovaných genů ve fetálních kosterních svalech prasete
Annotation in Czech
V průběhu embryonálního a fetálního vývoje savců jednotlivé geny specifické pro kosterní svaly vykazují jedinečné časoprostorové vzory exprese. Prenatální vývoj svalů do jisté míry předurčuje postnatální růst svalů/produkci masa u hospodářských zvířat. Vtomto projektu budeme studovat diferenčně exprimované geny (EST) v prasečích fetálních kosterních svalech (u 45-50ti-denního plodu). EST budou charakterizovány (sekvenování, hledání homologií v genových/EST databázích), budou navrženy PCR primery provybrané geny, tyto budou mapovány na RH panelu a u vybraných kandidátních genů bude studován polymorfismus (v genomické DNA), geny budou vazbově mapovány, zahrnuty do QTL map a budou využity pro hledání asociací s vybranými jatečními znaky v komerčníchpopulacích prasat. U vybraných genů bude studována genomická organizace, sekvence (částečná nebo úplná) a budou u nich hledány mutace v kódujících sekvencích, se záměrem identifikovat příčinné mutace pro znaky masné užitkovosti. Projekt je směrován na
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was aimed at the search for genes playing role in muscle growth in pigs, with the prospect of their application in MAS. Eight selected candidate genes for some carcass traits (SKI, GABRD, TGFB1, MPZ, LMNA, TGFBR1, OGN and ASPN) were analyzed
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
5,458 thou. CZK
Public financial support
3,250 thou. CZK
Other public sources
2,208 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK