Detailed mapping of QTLs in the pig by means of microsatellites and through comparative positional candidate gene approach

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.

Contest type

VS - Public tender

Contract ID

—

Project name in Czech

Detailní mapování QTL u prasat pomocí mikrosatelitů a kandidátních genů vybraných na základě komparativních map

Annotation in Czech

Účelem projektu je přispět k mezinárodnímu úsilí, zaměřenému na detailní mapování QTL, podmiňující kvalitu masa a jatečného těla u prasat pomocí mikrosatelitů a kandidátních genů, vybraných na základě komparativních map. Úsilí bude hlavně směrováno na: 1) typování mikrosatelitů v hohenheimských rodinách za účelem detailnější lokalizace některých QTL; 2) cytogenetické mapování EST ("expressed sequence tags") izolovaných ze svalové cDNA knihovny, cytogenetické a vazbové mapování genů Typu I za účelem saturace integrované mapy prasečího genomu; 3) výběr kandidátních genů, ovlivňujících kvalitu jatečného těla a masa v chromozómových oblastech, ve kterých byla prokázána existence jednoho nebo více QTL (hledání na homologních chromosomových úsecích v lidskéa myší genomové databázi), detekci alelických variant vybraných genů, jejich typování ve třech třígeneračních hohenheimských rodinách (divoké prase x piétrain, meishan x piétrain, divoké prase x meishan) a výpočet genových efektů.

R&D category

—

CEP classification - main branch

GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding

CEP - secondary branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry

Provider evaluation

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Project results evaluation

Při řešení projektu byly získány následující výsledky. Byl lokalizován QTL pro množství tuku na chromozomu X. Řešitel spolupracoval na lokalizaci QTL pro růst a množství tuku na chromozomu 4. Řešitelský kolektiv lokalizoval cytogenetickými metodami geny

Realization period - beginning

Jan 1, 1999

Realization period - end

Jan 1, 2001

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3

Data delivery date

Apr 1, 2003

Total approved costs

4,039 thou. CZK

Public financial support

3,377 thou. CZK

Other public sources

1,718 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK