Mapping of quantitative traits in the pig
Project goals
DNA technology providing numerous marker loci for genetic maps together with modern statistical methods enable the dissection of quantitaive traits to traits with Mendelian inheritance amenable to further genetic manipulation. The objective of the project is typing of microsatellites, eventually of candidate genes on chromosome 4 and on another not yet specified chromosome in three F2 reference families (Wild Boar x Pietrain, Meishan x Pietrain, Wild Boar x Meishan) producet at Hohenheim University andscoring of 38 classical markers in the third family for mapping of QTL using the least square method. Among the expected results are the extension of porcine genetic map and mapping of QTL which can be used for: improvment of commercial breeds by means of MAS, for manipulation of QTL by DNA technology, and as an animal model of human obesity.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Mapování kvantitativních znaků u prasat
Annotation in Czech
DNA technologie poskytují dostatečný počet polymorfních lokusů ke konstrukci genetických map, které, spolu s moderními statistickými metodami, umožňují disekci kvantitativních znaků na jednoduše dědičné znaky přístupné další genetické manipulaci. Předmětem projektu je testování mikrosatelitů, případně kandidátních genů na chromozómu 4 a dalším zatím nespecifikovaném chromozómu u tří F2 referenčních rodin (divoké prase x pitrain, meishan x pitrin, divoké prase x meishan) připravených Universitou v Hohenheimu a dále 38 klasických polymorfních znaků u poslední rodiny za účelem mapování QTL metodou nejmenších čtverců. Výsledkem bude rozšíření genetické mapy prasete a identifikace QTL. Poznatky budou použitelné: ke zlepšení komerčních plemen prasat prostřednictvím MAS: k manipulaci QTL pomocí DNA technologií: jako model lidské obezity.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Projekt je zaměřen na aktuální problematiku mapování genomu prasete. Bylo dosaženo nových publikovatelných výsledků. Pomocí polymorfních znaků byly na 3 třígeneračních F2 rodinách mapovány QTL na chromozomu 4 a 9 u prasat. Na chromozómu 4 byly zjištěny Q
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1998
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
4,616 thou. CZK
Public financial support
4,150 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 616 CZK thou.
Public support
4 150 CZK thou.
89%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
GH - Nutrition of farm animals
Solution period
01. 01. 1996 - 01. 01. 1998