Analysis of candidate genes influencing carcass traits in pigs by positional candidate gene approach
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Analýza kandidátních genů pro znaky jatečné hodnoty prasat, lokalizovaných v chromozómových oblastech s QTL
Annotation in Czech
V oblastech chromozómů prasat, ve kterých byla předchozím studiem (Geldermann et al.1999, Arch. Tierz., Dummerstorf 42, 67-81) prokázána existence QTL efektů, budou analyzovány kandidátní geny, zejména pro znaky jatečné hodnoty. V předkládaném projektu bude hlavní důraz kladen na chromozóm 4. Geny v QTL oblastech budou vybírány z prasečí genové mapy a databází dostupných na Internetu na základě biochemických a fyziologických funkcí jejich produktů. Ve studovaných genech bude zjišt'ován polymorfismus a asociace s QTL efekty ve třech hohenheimských třígeneračních rodinách (divoké prase x pietrain, meishan x pietrain a divoké prase x meishan). U genů, vykazujících signifikantní QTL efekty, bude studována genomická organizace a struktura. V oblastech chromozómů s velkými QTL efekty budou studovány DNA polymorfismy, způsobené záměnou jedné báze (SNP), při využití BAC klonů. Bude studována asociace zjištěných SNP s QTL efekty.Cílem projektu je jednak získat márkry pro geny s dostatečně velkými QTL
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
V rámci projektu bylo prostudováno 12 genů prasete lokalizovaném na chromozomu 4, ve kterém byla prokázána přítomnost QTL pro růst a jatečné znaky. Ve všech případech se jedná o prioritní poznatky o sekvenci těchto genů. U studovaných genů byl odhalen p
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
4,453 thou. CZK
Public financial support
3,200 thou. CZK
Other public sources
1,880 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK