Embryonics of pre-implantation mammalian development
Project goals
Pre-implantation development of mammals is distinguished by a series of critical events on the molecular level, from which the embryonic gene activation and cell differentiation are the most important. Understanding of these events is important either for developmental biology, or for practical applications as embryogenesis of farming animals or regenerative medicine. The first step of embryogenomics must be collecting and cDNA sequencing of such genes, which are expressed during early embryonic development. The most knowledge about the genome activation and expressed sequences is gathered so far on the mouse embryo. Owing to differences in the embryonic development between the mouse and other mammals the mouse is not however a suitable model either for farming animals, or a human being. We suggest using the method of subtractive hybridisation for finding the genes that are expressed in the pre-implantation development of cattle. The microarrays will represent the method for testing the
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
523/06/1226
Alternative language
Project name in Czech
Genomika preimplantačního vývoje savců
Annotation in Czech
Časný embryonální vývoj savců se vyznačuje řadou kritických dějů na molekulární úrovni, z nichž mezi nejdůležitější patří aktivace embryonálního genomu a diferenciace buněk. Pochopení těchto dějů je důležité jak pro vývojovou biologii, tak i pro praktické aplikace, jako je vývoj embryí hospodářských zvířat nebo regenerativní medicína. Prvním krokem embryogenomiky musí být nalezení a sekvenování cDNA těch genů, které se exprimují v časném embryonálním vývoji. Nejvíce poznatků o aktivaci genomu a exprimovaných sekvencích je zatím shromážděno na embryu myši. Vzhledem k rozdílům v embryonálním vývoji mezi myší a ostatními savci však myš není vhodným modelem pro hospodářská zvířata, ani pro člověka. Navrhujeme použít metodu subtraktivní hybridizace k nalezení genů, které se exprimují v preimplantačním vývoji skotu. Vyloučení "falešně pozitivních" klonů bude provedeno pomocí hybridizace na mikročipech. Kvantifikace exprese bude provedena pomocí real-time RT-PCR. Získané výsledky pomohou
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40203 - Husbandry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We determined the genes expressed during minor and major genome activation in preimplantation bovine embryo using the method of subtractive hybridization. Majority of these genes are activated during major genome activation (the late 8-cell stage), only
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Oct 22, 2009
Finance
Total approved costs
2,637 thou. CZK
Public financial support
2,637 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 637 CZK thou.
Public support
2 637 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008