All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Nontargeted and targeted metabolite profiling in urine of patients with breast or prostate cancer diagnosis

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

  • Main participants

    Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    P206-10-2401

Alternative language

  • Project name in Czech

    Profilování metabolitů a potenciálních biomarkerů v moči pacientů s diagnostikovanou rakovinou prsu nebo prostaty

  • Annotation in Czech

    V projektu je studována přímá derivatizace/extrakce ethylchlorformiátem pro účely studia metabolitů ve vzorcích moči pacientů s rakovinou prsu nebo prostaty. Bude identifikována většina metabolitů nalezených v moči navrhovanou metodou a korelován jejich výskyt s klinickými údaji pomocí vyvinuté platformy Metabolite Mapper a chemometrických metod. Metoda bude nejprve validována pro stanovení nového potenciálního biomarkeru rakoviny prostaty sarkosinu a dalších metabolitů sarkosinové dráhy. Dále bude zkoumána nová derivatizační strategie, založená na působení fluoralkylchlorformiátů pro profilování androgenů, estrogenů a dalších steroidů v moči. Dalším cílem projektu je cílená a necílená analýza metabolitů v moči s využitím izotopicky značených trideuteroethylchlorformiátových a dideuterotrifluoroethylchlorformiátových činidel. Nově vypracovaná strategie bude využita k systematické analýze močí pacientů s diagnostikovanou rakovinou prsu a prostaty ve skupinách minimálně 300, resp. 200 pacientů a odhadu podílu jednotlivých metabolitů na rozvoji nemoci a vyhodnocení jejich potenciálu jako klinického biomarkeru. V neposlední řadě bude nová metodologie použita k systematickému výzkumu močí kontrolní skupiny min. 10 dobrovolníků pro získání  jejich osobního metabolického profilu v delším období.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CB - Analytical chemistry, separation

  • CEP - secondary branch

    FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition

  • CEP - another secondary branch

    CE - Biochemistry

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    The aim was to optimize sample preparation methodology using alkylchloroformates for profilling methabolites using GC-MS and LC-MS in different matrices, mainly in urine and plasma. As the new result can be counted information, that sarkosin and its metabolites are not convenient as bioindicator for early diagnosis of prostate cancer. 6 publications are result of the project.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2010

  • Realization period - end

    Dec 8, 2014

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 1, 2014

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP15-GA0-GA-U/01:2

  • Data delivery date

    Sep 30, 2017

Finance

  • Total approved costs

    3,358 thou. CZK

  • Public financial support

    3,358 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK