Nontargeted and targeted metabolite profiling in urine of patients with breast or prostate cancer diagnosis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P206-10-2401
Alternative language
Project name in Czech
Profilování metabolitů a potenciálních biomarkerů v moči pacientů s diagnostikovanou rakovinou prsu nebo prostaty
Annotation in Czech
V projektu je studována přímá derivatizace/extrakce ethylchlorformiátem pro účely studia metabolitů ve vzorcích moči pacientů s rakovinou prsu nebo prostaty. Bude identifikována většina metabolitů nalezených v moči navrhovanou metodou a korelován jejich výskyt s klinickými údaji pomocí vyvinuté platformy Metabolite Mapper a chemometrických metod. Metoda bude nejprve validována pro stanovení nového potenciálního biomarkeru rakoviny prostaty sarkosinu a dalších metabolitů sarkosinové dráhy. Dále bude zkoumána nová derivatizační strategie, založená na působení fluoralkylchlorformiátů pro profilování androgenů, estrogenů a dalších steroidů v moči. Dalším cílem projektu je cílená a necílená analýza metabolitů v moči s využitím izotopicky značených trideuteroethylchlorformiátových a dideuterotrifluoroethylchlorformiátových činidel. Nově vypracovaná strategie bude využita k systematické analýze močí pacientů s diagnostikovanou rakovinou prsu a prostaty ve skupinách minimálně 300, resp. 200 pacientů a odhadu podílu jednotlivých metabolitů na rozvoji nemoci a vyhodnocení jejich potenciálu jako klinického biomarkeru. V neposlední řadě bude nová metodologie použita k systematickému výzkumu močí kontrolní skupiny min. 10 dobrovolníků pro získání jejich osobního metabolického profilu v delším období.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
FB - Endocrinology, diabetology, metabolism, nutrition
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim was to optimize sample preparation methodology using alkylchloroformates for profilling methabolites using GC-MS and LC-MS in different matrices, mainly in urine and plasma. As the new result can be counted information, that sarkosin and its metabolites are not convenient as bioindicator for early diagnosis of prostate cancer. 6 publications are result of the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 8, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:2
Data delivery date
Sep 30, 2017
Finance
Total approved costs
3,358 thou. CZK
Public financial support
3,358 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK