Mass Spectrometry in Cancer Research: Lipid Biomarkers for Early Diagnostics
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
ERC CZ
Call for proposals
ERC CZ 2 (SMSM2013LL1)
Main participants
Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-24083/2013
Alternative language
Project name in Czech
Hmotnostní spektrometrie při hledání lipidových biomarkerů pro včasnou diagnostiku rakoviny
Annotation in Czech
Tento projekt hraničního výzkumu je založen na skutečnosti, že rakovina ovlivňuje metabolické složení buněk, což může být využito při hledání lipidových biomarkerů pro včasnou diagnostiku rakoviny. Biochemické změny se také odráží ve složení tělesných tekutin využitelných pro neinvazivní screening rakovinového onemocnění. Včasná diagnóza rakoviny zásadním způsobem zvyšuje šanci pacienta na přežití, zejména u typů rakoviny bez spolehlivého screeningového programu a vysoké mortality, jako např. rakovina plic, prostaty, ledvin a slinivky. Cílem našeho komplexního přístupu lipidového profilování je nalezení molekul lipidů s výrazným zvýšením či snížením koncentrace v biologických vzorcích vyoperovaných nádorů a sousedních zdravých tkání, krve, moči nebo kondenzátu dechu pacientů trpících rakovinou a zdravých dobrovolníků. Nové studie naznačují, že lipidomické změny se mohou týkat např. zvýšené aktivity glykosylačních enzymů a také oxidací lipidů s polynenasycenými mastnými kyselinami, takže potenciální biomarkery rakoviny budou hledány zejména v těchto skupinách lipidů. Široké spektrum moderních hmotnostně-spektrometrických technik ve spojení se separačními technikami v kapalné fázi bude použito pro hledání biomarkerů společně s vícerozměrnou statistickou analýzou. Kvantifikace jednotlivých tříd lipidů bude provedena pomocí nově vyvinutých UHPLC/MS metod. Mezi další moderní metody analýzy budou patřit vícerozměrné separační techniky včetně regioisomerní analýzy, chirální separace a hmotnostně spektrometrické zobrazování prostorové distribuce lipidů v biologických tkáních. Databáze lipidomického složení plazmy bude vytvořena s využitím všech měřených vzorků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New methods have been developed for the lipidomic analysis of biological samples, which have been applied for the determination of wide range of lipids in samples of cell lines, tumor tissues, and mainly body fluids (plasma, serum, and urine) of patients with various types of cancer and healthy volunteers. The developed statistical models can differentiate with high accuracy groups of patients and healthy volunteers, which is applicable for early cancer diagnosis.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2013
Realization period - end
Jun 30, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 2, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-MSM-LL-U/01:1
Data delivery date
Jun 18, 2019
Finance
Total approved costs
45,529 thou. CZK
Public financial support
45,529 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK