Prospective study on early pancreatic cancer detection and therapy monitoring using lipidomic profiling by mass spectrometry
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202100001
Main participants
Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU21-03-00499
Alternative language
Project name in Czech
Prospektivní studie na včasnou detekci karcinomu pankreatu a sledování průběhu léčby na základě lipidomického profilování hmotnostní spektrometrií
Annotation in Czech
Tento projekt je zaměřen na analýzu lipidomického složení krevního séra a nádorových tkání pacientů s karcinomem pankreatu ve srovnání se zdravými kontrolami. Prospektivní sběr vzorků séra a tkání společně se sběrem klinických informací a měřením základních klinických parametrů bude probíhat ve FN Olomouc, FN Hradec Králové a na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci. Kromě toho bude využita i sada vzorků z biobanky FN Olomouc za účelem optimalizace analytické metodologie pro lipidomickou analýzu, která bude provedena na Univerzitě Pardubice s cílem stanovení molárních koncentrací minimálně 200 lipidů z 5 kategorií lipidů (fosfolipidy, sfingolipidy, glycerolipidy, steroly a mastné kyseliny). Celý pracovní postup bude optimalizován pro budoucí rutinní využití v klinické laboratoři, tedy s využitím nízkorozlišujícího hmotnostního spektrometru typu trojitého kvadrupólu, který se dnes již stává běžnou výbavou klinických laboratoří. Pomocí vícerozměrné analýzy dat budou vytvořeny statistické modely pro rozlišení skupin pacientů od zdravých kontrol včetně stanovení správnosti metody, sensitivity a specificity. Dalším úkolem bude sledování průběhu léčby v korelaci s lipidomickým profilem séra pacientů. Všechna získaná klinická a analytická data budou společně vyhodnocena s použitím moderních bioinformatických postupů s cílem nalezení nejvíce dysregulovaných lipidů pro karcinom pankreatu, což podle dosavadních výsledků jsou zejména downregulované mononenasycené sfingomyeliny s dlouhým alifatickým řetězcem (SM 41:1, SM 39:1, SM 42:1, atd.) a upregulované fosfolipidy a sfingolipidy složené z kombinací 16:0 a 18:1 mastných kyselin. Finálně bude celá metodologie převedena do VFN v Praze, aby se ověřila možnost realizace celého postupu za podmínek klinické laboratoře. Cílem projektu je optimalizace celého postupu od odběru vzorků až po způsob reportování výsledků a příprava metody pro následnou klinickou validaci.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Apr 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-MZ0-NU-R
Data delivery date
Feb 21, 2024
Finance
Total approved costs
14,007 thou. CZK
Public financial support
14,007 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK