Prospective study on early pancreatic cancer detection and therapy monitoring using lipidomic profiling by mass spectrometry
Public support
Provider
Ministry of Health
Programme
—
Call for proposals
SMZ0202100001
Main participants
Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
NU21-03-00499
Alternative language
Project name in Czech
Prospektivní studie na včasnou detekci karcinomu pankreatu a sledování průběhu léčby na základě lipidomického profilování hmotnostní spektrometrií
Annotation in Czech
Tento projekt je zaměřen na analýzu lipidomického složení krevního séra a nádorových tkání pacientů s karcinomem pankreatu ve srovnání se zdravými kontrolami. Prospektivní sběr vzorků séra a tkání společně se sběrem klinických informací a měřením základních klinických parametrů bude probíhat ve FN Olomouc, FN Hradec Králové a na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci. Kromě toho bude využita i sada vzorků z biobanky FN Olomouc za účelem optimalizace analytické metodologie pro lipidomickou analýzu, která bude provedena na Univerzitě Pardubice s cílem stanovení molárních koncentrací minimálně 200 lipidů z 5 kategorií lipidů (fosfolipidy, sfingolipidy, glycerolipidy, steroly a mastné kyseliny). Celý pracovní postup bude optimalizován pro budoucí rutinní využití v klinické laboratoři, tedy s využitím nízkorozlišujícího hmotnostního spektrometru typu trojitého kvadrupólu, který se dnes již stává běžnou výbavou klinických laboratoří. Pomocí vícerozměrné analýzy dat budou vytvořeny statistické modely pro rozlišení skupin pacientů od zdravých kontrol včetně stanovení správnosti metody, sensitivity a specificity. Dalším úkolem bude sledování průběhu léčby v korelaci s lipidomickým profilem séra pacientů. Všechna získaná klinická a analytická data budou společně vyhodnocena s použitím moderních bioinformatických postupů s cílem nalezení nejvíce dysregulovaných lipidů pro karcinom pankreatu, což podle dosavadních výsledků jsou zejména downregulované mononenasycené sfingomyeliny s dlouhým alifatickým řetězcem (SM 41:1, SM 39:1, SM 42:1, atd.) a upregulované fosfolipidy a sfingolipidy složené z kombinací 16:0 a 18:1 mastných kyselin. Finálně bude celá metodologie převedena do VFN v Praze, aby se ověřila možnost realizace celého postupu za podmínek klinické laboratoře. Cílem projektu je optimalizace celého postupu od odběru vzorků až po způsob reportování výsledků a příprava metody pro následnou klinickou validaci.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
According to the report, the defined objectives of the project were achieved. The number of biological samples was consistent with the anticipated scope; however, compared with the original concept, new methodological approaches for the quantification of lipids in plasma and serum had to be developed and optimized. These approaches enabled the identification of diagnostically relevant lipid classes and contributed to improved discrimination between healthy controls and patients. Dysregulation of lipid metabolism was demonstrated, together with alterations in the lipidomic profile detectable already at early stages of the disease. The significance of the project lies in its practical impact on clinical medicine, particularly through the translation of the results into practice via the successful accreditation of the spin-off company Lipidica. The project generated high-quality outputs: 9 original research articles were published, including three in Q1and two in D1 journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 4, 2025
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP26-MZ0-NU-U
Data delivery date
Jul 13, 2026
Finance
Total approved costs
14,053 thou. CZK
Public financial support
13,978 thou. CZK
Other public sources
75 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK