Influence of conformation and chemical modification on the behavior of oligonucleotides at electrodes: towards the development of DNA sensors
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P206-12-2378
Alternative language
Project name in Czech
Vliv konformace a chemické modifikace na chování oligonukleotidů na elektrodách: příspěvek k vývoji DNA senzorů
Annotation in Czech
Projekt se zabývá studiem vlivu struktury a chemické modifikace syntetických oligonukleotidů (ON) na jejich elektrochemické chování. U dvouřetězcových ON bude studován vztah mezi nukleotidovou sekvencí, polohou elektroaktivních bází a elektrochemickým chováním těchto ON. Vliv tvorby alternativních sekundárních struktur DNA (triplexy, vlásenky, tetraplexy) bude zkoumán za použití modelových ON, které tyto struktury tvoří. Podobně jako vliv struktury bude také studován vliv chemické modifikace a to jak modifikace bází DNA (komplexy kovů, různé organické funkční skupiny), tak i modifikace cukrfosfátové kostry DNA (koncová modifikace, modifikace celé kostry srovnání chování DNA, RNA a PNA). Poznatky o elektrochemickém chování budou doplněny studiem mezifázového chování těchto ON. Získané výsledky přispějí k pochopení elektrochemického a mezifázového chování ON na různých typech elektrod a budou také využity při vývoji senzorů pro detekci DNA hybridizace a DNA interakcí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CG - Electrochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project solves impact of secondary DNA structures, such as guanidine quadruplexes and hairpin structure, on the electrochemical behavior of the oligonucleotides, and synthesis of electrochemically active associates of deaza analogues of purine bases with osmium tetroxide - 2,2'-bipyridine complex. The results are based for four impacted papers.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
5,517 thou. CZK
Public financial support
5,517 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK