Interfacial and electrochemical behavior of synthetic oligonucleotides: effects of nucleotide sequence, conformation and chemical modification
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA400040903
Alternative language
Project name in Czech
Mezifázové a elektrochemické chování syntetických oligonukleotidů: vliv nukleotidové sekvence, konformace a chemické modifikace
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na systematické studium mezifázových a elektrochemických vlastností syntetických oligonukleotidů (ON) s ohledem na jejich nukleotidovou sekvenci, sekundární strukturu a chemickou modifikaci. Detailně bude studován vztah mezi primární strukturou ON, jejich interakcemi s elektricky nabitými povrchy a elektrochemickou aktivitou zbytků bází. Budou navrženy ON vytvářející různé sekundární struktury a bude zkoumáno jejich chování na elektrodách, zejména adsorpčně-desorpční vlastnosti, přístupnost bází elektrochemické redukci/oxidaci a změny struktury na povrchu elektrody pod vlivem vloženého potenciálu. Podobně budou zkoumány chemicky modifikované ON (např. obsahujících alkylované báze, nebo adukty s komplexy kovů). Vlastnosti DNA oligonukleotidů budou porovnány s RNA a případně s dalšími syntetickými analogy nukleových kyselin. Předpokládáme, že výsledky projektu přispějí k detailnímu pochopení chování ON na elektrodách a budou využity při vývoji nových DNA senzorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
It was found, that formation of DNA alternative structures affect interfacial and electrochemical behavior of ODN adopting these structures. Methods were introduced for analysis of DNA modification by Pt complexes and for detection of unpaired T in DNA.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
2,112 thou. CZK
Public financial support
2,112 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK