Application of electrochemical methods in studies of oligonucleotides as models of unusual DNA structures
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 6 (SAV02006-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA400040611
Alternative language
Project name in Czech
Využití elektrochemických metod při studiu oligonukleotidů jako modelů alternativních struktur DNA
Annotation in Czech
Navrhujeme studovat syntetické oligonukleotidy (ODN) pomocí elektrochemických metod na rtuťových a uhlíkových elektrodách. Budou získány informace o vlivu nukleotidové sekvence a délky ODN na jejich elektrochemické chování. Dále bude zkoumáno elektrochemické chování ODN zaujímajících různé sekundární struktury (kromě dvouřetězcové formy vlásenky, triplexy a kvadruplexy). Přechod mezi těmito strukturami je často doprovázen změnou dostupnosti určitých zbytků bazí, což následně ovlivní měřené elektrochemické signály. K tvorbě alternativních struktur DNA dochází za různých podmínek (pH, přítomnost iontů kovů); proto bude většina experimentů provedena pomocí přenosové techniky, umožňujících měnit podmínky, za nichž jsou ODN adsorbovány na elektrodách při zachování konstantních podmínek elektrochemických měření. Kromě rozšíření základních znalostí v oblasti elektrochemie DNA je jedním z cílů projektu navrhnout nové analytické přístupy, využitelné v oblasti praktické DNA diagnostiky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Information about the influence of number, type and position of electroactive bases in molecule of ss and ds ODN on their electrochemical behavior was obtained. Sensor for DNA hybridization detection based on using ODNs forming hairpins was proposed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 21, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2009
Finance
Total approved costs
1,446 thou. CZK
Public financial support
1,446 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK