Molecular mechanism of autocatalytic protein splicing of the RTX protein FrpC from Neisseria meningitidis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P207-11-0717
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismus autokatalytického proteinového sestřihu RTX proteinu FrpC z Neisseria meningitidis
Annotation in Czech
Sestřih proteinu je posttranslační modifikace proteinů založená na unikátním mechanismu autokatalytického štěpení výchozího polypeptidu a následnému spojení rozštěpených fragmentů pomocí peptidové vazby. V nedávné době jsme objevili novou navápníku závislou samoštěpící doménu (SPM) proteinu FrpC z Neisseria meningitidis, která je schopna rozštěpit peptidovou vazbu mezi aminokyselinami Asp aPro, a zároveň umožňuje vytvořit izopeptidovou vazbu mezi karboxylovou skupinouAsp odštěpeného proteinu a ε-amino skupinou na okolním lysinu (proteinovýsestřih in trans). Cílem tohoto projektu je objasnit strukturní a funkční charakteristiky proteinového sestřihu založeného na SPM a jeho potenciální využití v proteinovém inženýrství. Trojrozměrná struktura SPM umožní detailní pohled na mechanismus autokatalytického štěpení Asp-Pro vazby a zároveň pomůže objasnit úlohu vápenatých iontů v tomto procesu. Schopnosti odštěpeného fragmentu reagovat s okolními primárními aminy bude využito na vývoj alternativního přístupu k chemické modifikaci proteinů založené na SPM.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Structural and functional characterization of so called "self-cleaving" module found in the polypeptide chain in proteins of the family of gram-positive bakcteria was achieved. The obtained results were published in high level journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
14,100 thou. CZK
Public financial support
14,100 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK