Structure and function of sensor domain of proteinkinase StkP and its relationship to cellular processes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P207-12-1568
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a funkce senzorové domény proteinkinasy StkP eukaryotického typu a její vztah k buněčným procesům
Annotation in Czech
Bakteriální proteinkinasy typu PknB jsou signální proteiny charakteristické přítomností intracelulární kinázové domény na N-konci proteinu, transmembránovým úsekem a senzorovou doménou tvořenou opakujícím se motivem PASTA (penicilin-binding protein and Ser/Thr kinase associated domains) v extracelulární části na C-konci molekuly. Motiv PASTA byl identifikován v penicilin vazebném proteinu, a bylo zjištěno, že interaguje s beta-laktamovým kruhem cefuroximu. Vzhledem k tomu, že beta-laktamový kruh je strukturně podobný D-Ala-D-Ala motivu peptidoglykanu, byla formulována hypotéza, že efektorovou molekulou proteinkinas s PASTA motivy jsou podjednotky peptidoglykanu. V tomto projektu určíme trojrozměrnou strukturu senzorové domény proteinkinasy StkP a aminokyselinové zbytky zodpovědné za vazbu molekul ligandu. Záměnou vazebných aminokyselin za neutrální zbytky připravíme senzorovou doménu s nulovou vazebnou kapacitou a docílíme zablokování signální kaskády přímo na jejím vstupu. Budeme studovat vliv přerušení signální dráhy na další cílové molekuly StkP a na buněčné funkce.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
The project did not afford sufficient number of outputs. The goals of the project were not fully achieved in appropriate project period.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 30, 2017
Finance
Total approved costs
4,374 thou. CZK
Public financial support
4,374 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK