Integrated microRNA, mRNA expression profiling, linkage and correlation analyses for identification of genes underlying complex traits
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P301-10-0290
Alternative language
Project name in Czech
Integrovaná analýza profilů exprese mikroRNA a mRNA s vazebnými a korelačními analýzami pro odhalení genů podmiňujících komplexní znaky
Annotation in Czech
MikroRNA (miRNA) představují nový druh endogenních, krátkých, nekódujících RNA, které kontrolují expresi genů a hrají tak významnou úlohu při regulaci fyziologických a patofyziologických procesů. V předkládaném projektu stanovíme profily exprese miRNA vřadě tkání důležitých pro patogenezi metabolického syndromu u 30 BXH/HXB rekombinantních inbredních kmenů potkana a budeme testovat hypotézu, že variabilita v expresi miRNA je podmíněna geneticky a že bude možné odhalit odpovědné genetické determinanty jako cis a trans regulované lokusy expresních kvantitativních znaků (eQTL). Korelace profilů exprese miRNA s hladinami mRNA a s fyziologickými znaky pak přispěje k odhalení fyziologických QTL na molekulární úrovni. Funkční relevance vybraných miRNA bude prokázána pomocí transgeneze s miRNA geny. Předkládaný projekt přispěje k pochopení regulace miRNA a jejich úlohy v patogenezi klinicky důležitých kardiovaskulárních a metabolických poruch.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main contribution are new findings on essential hypertension and metabolic syndrome on the rat model. In 7 papers dedicated to the project the PI served once as the first author. Most of the miRNA results, presented in detail in annual reports, remain unpublished. Only one publication was dedicated to miRNA. However, all papers were published in top-level journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
6,393 thou. CZK
Public financial support
6,393 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK