Pathogenesis of spontaneous hypertension: integrated analysis of intermediary phenotypes of autonomic/sympathetic system and gene expression profiles in rat recombinant inbred strains
Project goals
The metabolic syndrome is a very common precursor of cardiovascular disease. In the current project, we will analyze the role of autonomic intermediate phenotypes in the pathogenesis of metabolic syndrome using recombinant inbred (RI) strains derived from the SHR (spontaneously hypertensive rat) and BN (Brown Norway) progenitors. Genome of RI strains is covered by more than 1000 gene markers and the strains are characterized in multiple hemodynamic and metabolic traits and in gene expression profiles inrenal, adrenal, and adipose tissues (WebQTL database - www.genenetwork.org). We will use linkage, correlation, and cluster analyses to identify genetic determinants of autonomic intermediate phenotypes, their relationship to metabolic and hemodynamic traits and regulatory gene networks. Identification of responsible genes will shed light on the role of autonomic system in the pathogenesis of metabolic syndrome and contribute to its rational prevention and therapy.
Keywords
metabolic syndromeautonomic nervous systemSHR strainrecombinant inbred strainsgene expression profiles
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 6 (SAV02006-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500110604
Alternative language
Project name in Czech
Patogeneze spontánní hypertenze: integrovaná analýza intermediárních fenotypů autonomního/sympatického systému a profilů genové exprese u rekombinantních inbredních kmenů potkana
Annotation in Czech
Metabolický syndrom často předchází vývinu kardiovaskulárních chorob. V předkládaném projektu stanovíme u HXB/BXH rekombinantních inbredních (RI) kmenů, odvozených od SHR (spontánně hypertenzní potkan) a BN (Brown Norway) kmenů, intermediární fenotypy autonomního systému a budeme testovat úlohu těchto intermediárních fenotypů v patogenezi metabolického syndromu. Genom RI kmenů je pokryt více než 1000 márkry a RI kmeny jsou charakterizovány v řadě hemodynamických a metabolických znaků a v profilech genové exprese v ledvinách, nadledvinách a v tukové tkáni (viz databáze WebQTL - www.genenetwork.org). Pomocí vazebných, korelačních a shlukovacích analýz odhalíme genetické determinanty autonomních intermediárních fenotypů, jejich vztah s metabolickými a hemodynamickými fenotypy a genové interakce při jejich regulaci. Odhalení odpovědných genů přispěje k pochopení úlohy autonomního systému v patogenezi kardiovaskulárních onemocnění a k jejich racionální prevenci a terapii.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FA - Cardiovascular diseases including cardio-surgery
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30201 - Cardiac and Cardiovascular systems
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
A downregulation of Dbh, Pnmt, Vamp1, Vmat1 a Chga catecholaminergic genes in the SHR rat. Dbh and Pnmt activities correlated negatively with blood pressure were found. These heritable chenges in expression affects catecholamine action and blood pressure.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jun 8, 2010
Finance
Total approved costs
2,872 thou. CZK
Public financial support
2,872 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
2 872 CZK thou.
Public support
2 872 CZK thou.
0%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2009