Genetic and correlation analyses of lipidome in rat model of metabolic syndrome for identification of disease biomarkers
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-04859S
Alternative language
Project name in Czech
Genetické a korelační analýzy lipidomu u potkaního modelu metabolického syndromu pro odhalení biomárkrů tohoto onemocnění
Annotation in Czech
Poruchy lipidového metabolizmu, jako hyperlipidémie, hrají důležitou úlohu v patogenezi metabolického syndromu. Lipidy mají v buňkách různé funkce, strukturní, transportní, signalizační a zásobní. V předkládaném projektu budeme testovat hypotézu, že specifické lipidomické komponenty jsou geneticky podmíněné intermediární fenotypy, které mají důležitou úlohu v patogenezi metabolických a hemodynamických poruch u spontánně hypertenzních potkanů a představují tak biomárkry asociované s těmito poruchami. Navrhujeme využít genetické perturbace lipidomických komponent – globální a cílená lipidomická data – u BXH/HXB rekombinantních inbredních kmenů s cílem odhalit klastry koregulovaných lipidů a biochemické dráhy specifických lipidů pro identifikaci klíčových změn v biosyntetických vztazích, které budou prediktivní ohledně parametrů metabolizmu glukózy a lipidů a krevního tlaku. Zatímco globální lipidomické profily nejsou klinicky proveditelné, odhalení klíčových biomárkrů by mohlo zlepšit ohadnutí rizika onemocnění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project studied genetic perturbation of lipidome components in rat recombinant inbred strains to identify changes in metabolism of specific lipids. Results were published in two original papers. The third paper is a review. This indicates that targets of the project were essentially accomplished, but in the context of a large team solving the project, the publication impact of the project is low.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 17, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,171 thou. CZK
Public financial support
5,976 thou. CZK
Other public sources
195 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK