Functional analysis of the BRCA1 alternative splicing variants in vitro and their relationship to the mammary carcinogenesis.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P301-12-1850
Alternative language
Project name in Czech
Funkční analýza alternativních sestřihových forem genu BRCA1 in vitro a jejich význam v procesu mamární kancerogeneze.
Annotation in Czech
Protein BRCA1 sehrává základní úlohu při reparaci dvouřetězcových zlomů DNA. Mutace v genu BRCA1 jsou nejčastější příčinou dědičné formy karcinomu prsu v ČR. Alternativní sestřihové formy BRCA1 mRNA byly popsány v buňkách somatických, nádorových i tk. kultur, avšak jejich význam a biologické účinky zkrácených forem BRCA1 proteinu jsou prakticky neznámé. Naše pilotní experimenty studia exprese vybraných alternativních sestřihových forem BRCA1 ukazují, že některé mohou interferovat s aktivitou wt BRCA1 proteinu v reparačních dějích. Cílem předkládaného projektu je charakterizace spektra biologických aktivit alternativních sestřihových variant BRCA1 in vitro a jejich možného podílu na procesu mamární kancerogeneze. Vybrané alternativní sestřihové varianty budou exprimována v modelových liniích ca prsu (MCF-7, HCC1937) a studován bude zejména jejich vliv na DNA reparační děje po genotoxickém poškození buněk (kinetiku vzniku reparačních ohnisek, přesnost a preferenci užití jednotlivých reparačních drah (HR vs. HNEJ) a charakter vznikajících reparačních komplexů s proteinem BRCA1).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project has fulfilled its proposed assignment. They obtain new knowledge about expression of BRCA1 ASVs in breast cancer model lines, including characterization of two variants with negative effect on function and two that retain DNA break repair function. The results are summarized in the project and published in two papers, and are an important contribution to the scientific field.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Jan 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
6,744 thou. CZK
Public financial support
6,744 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK