Global proteome analysis of temperature perception in Arabidopsis and its cross-talk with cytokinin signaling on proteome and growth response levels
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-12-2144
Alternative language
Project name in Czech
Globální proteomická analýza percepce teploty u Arabidopsis a její interakce se signalní drahou cytokininů na úrovni proteomické a růstové odezvy
Annotation in Czech
Rostliny se musí adaptovat na neustále se měnící vnější podmínky včetně často výrazných změn teploty v průběhu diurnálních cyklů. Stupeň odolnosti k teplotnímu a chladovému šoku má přímý dopad na fitness rostlin a následně na jejich produktivitu. Přesto zůstává míra poznání percepce teploty nízká. Globální transkriptomická analýza odhalila transkripty diferenciálně regulované teplotou a mezi nimi transkripty zúčastněné v signální dráze rostlinného hormonu cytokininu (CK). Pro hlubší pochopení relevance dřívějších transkriptomických dat navrhujeme identifikovat frakce rostlinného proteomu a fosfoproteomu, které podléhají diferenciální regulaci za teplotního a chladového šoku u Arabidopsis. CK byly implikovány ve zvýšení tolerance k teplotnímu šoku a byla předpokládána interakce mezi signálními drahami teploty a CK. Dále tedy navrhujeme podrobnou analýzu vzájemné modulace signalizace teploty a CK, která povede k novým poznatkům o interakci těchto dvou signálních drah na proteomické úrovni a následně k její projekci do regulace růstu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
ED - Physiology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The five year project focused on the metabolic changes induced by temperature and diurnal cycle in Arabidopsis thaliana. The project followed the specific role of plant hormones in the response and relied mainly on the OMICS approaches. It resulted into four publications in high quality journals and three review articles. Overall, the project can therefore be considered as successful.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 5, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
12,811 thou. CZK
Public financial support
12,811 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK