Integrating proteomic and genomic tools to contribute evolutionary processes across the plant kingdom with emphasis to the family of cytokinins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-11-0774
Alternative language
Project name in Czech
Propojení proteomických a genomických přístupů při objasňování evolučních procesů napříč rostlinnou říší s důrazem na rodinu cytokininů
Annotation in Czech
Konstrukce fylogenetických stromů je významným nástrojem k porozumění rostlinné biologie. Ve studiích objasňujících fylogenetické vztahy mezi rostlinami bylo již použito celé řady různých molekulárních markerů. Tento projekt je zaměřen na rodinu cytokininových (CK) hormonů, které hrají důležitou roli při regulaci růstu a vývoje rostlin, s důrazem na studium jejich deaktivace. Hlavní cíle projektu spočívají (1) v detailním průzkumu a definování výskytu deaktivačních CK forem (N- a O-glukosidů a derivátůcis-zeatinu [cisZ]) během evoluce v rostlinné říši, (2) ve studiu rozšíření genu kódujícího cisZ-O-glukosyltransferázu (cisZOG1, UDP-glukosyltransferázová rodina) jako spojujícího prvku sledovaných CK down-regulačních drah a začlenění ke známým fylogenetickým signálům (např. rbcL, atpB, matK, 18S rDNA, 26S rDNA) za účelem prokázání evoluce tohoto genu u rostlin a (3) v charakterizaci různých aspektů syntézy a metabolické konverze CK glukosidů a cis-zeatinů, jejich regulace a potenciální role při řízenífyziologicky důležitých procesů (odpověď rostlin na stres, senescence, morfogeneze).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Comprehensive study of the evolution of cytokinines in various (phylogenetic, population, ontogenetic, intraplant) scales. The project was well managed and financial costs were economically used according to the rules of founder. The results were published in 13 publication in journals indexed in WoS including high impacted (J. Exp. Bot., Plant Physiol., New Phytol.).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 19, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
10,428 thou. CZK
Public financial support
10,428 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK