Genome evolution in Cardamine allopolyploids of contrasting phylogenetic age
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-10-1014
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří
Annotation in Czech
Polyploidie hraje významnou roli při speciaci semenných rostlin. Nicméně překvapivě málo je známo o stabilitě chromosomů v prvních generacích po vzniku alopolyploidů a u evolučně mladých polyploidů. Poprvé bude použita technika kombinované GISH a SMC (genomická in situ hybridizace a srovnávací malování chromosomů) u hybridních a alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) k analýze intergenomických chromosomových interakcí. GISH identifikuje rodičovské chromosomové sady a intergenomické translokace, zatímco SMC odhalí inter- a intrachromosomové přestavby. Stabilita chromosomů bude analyzována u nedávno (ca. 100 let) vzniklého triploidního hybrida C. ´ insueta (2n=24) a autoalohexaploida C. schulzii (2n=48), a u evolučně staršího druhu C. flexuosa (2n=32). U tří analyzovaných alopolyploidních taxonů budou etablovány syntetické linie a chromosomová stabilita monitorována v posloupných generacích. Příčiny karyologické variability budou studovány na základě analýzy jaderných a chloroplastových markerů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
It was confirmed that Cardamine flexuosa originated from C.amara x C.hirsuta hybridization. The origin of hybrigenous Cardamine populations was elucidated. Two papers and one chapter in book were published, some data are in preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Apr 15, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:2
Data delivery date
Sep 30, 2017
Finance
Total approved costs
6,743 thou. CZK
Public financial support
6,743 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK