Interactions of mutant forms of cryptogein with a membrane binding site: biosensors-based characterisation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-11-1003
Alternative language
Project name in Czech
Interakce mutantních forem cryptogeinu s membránovým vazebným místem: charakterizace pomocí biosensorů
Annotation in Czech
Elicitiny patří do rodiny nízkomolekulárních proteinů sekretovaných celou řadou druhů oomycety Phytophtora, která vykazuje devastující účinky v zemědělství a přírodních ekosystémech. U tabáku vyvolávají obranou reakci. Kryptogein je 10 kDa elicitor uvolňovaný fytoparazitem Phytophtora cryptogea. Byly již velmi dobře popsány procesy v rámci obranné reakce vyvolané aplikací kryptogeinu, avšak vlastní interakce elicitinů s vysokoafinitním místem v plasmatické membráně nebyla ještě zcela popsána. Navrhovaný projekt je zaměřen právě na objasnění interakce mezi elicitinem a vysokoafinitním místem na molekulární úrovni. Pro specificky orientovanou imobilizaci na čip bude použita speciální kyselá varianta kryptogeinu B20. Ke sledování interakce v reálném čase budou využity pokrokové měřící techniky na bázi biosensorů, SPR systém Biacore 3000 a piezoelektrický biosensor. Rovněž bude proveden pokus o izolaci tohoto vysokoafinitního místa.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project focused on the study of interactions of the elicitor cryptogein with a bindig site at the cytoplasmic membrane of tobacco cell. In the framework of the project, valuable information about the binding interactions and changes in the composition of membrane proteins were obtained. The results of the project were published in 4 papers in high quality journals with impact factor.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
6,228 thou. CZK
Public financial support
6,228 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK