Functional characterisation of pollen unique storage ribonucleoprotein particles
Project goals
Male gametophyte, highly organized haploid flower organ, offers unique chance to analyze development and differentiation of single haploid cell, cell-cell interaction and recognition, cellular polarity and pollen tube tip growth. Posttranscriptional control of gene expression plays a vital role during tobacco pollen maturation and tube growth. Number of pollen mRNAs were shown to be bound to pollen-specific stored ribonucleoprotein particles annotated as EPP complexes. Just like the role played in growing mammalian neurons, EPP particles represent pre-loaded complex machinery devoted to mRNA processing, transport, subcellular localization and protein synthesis. Here we aim to perform detailed functional, transcriptomic and proteomic characterisation ofpollen storage RNP particles. In particular, we aim to integrate our knowledge on translationally regulated transcripts in developing pollen and to identify and find the mode of action of proteins and/or small RNAs involved in translational repression of mRNAs stored in developing pollen and gradually activated during progamic phase.
Keywords
translationregulationmalegametophytetobaccoproteomicsstoredmRNARNA-bindingproteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-11-1462
Alternative language
Project name in Czech
Funkční charakterizace unikátních zásobních ribonukleoproteinových částic v pylu
Annotation in Czech
Samčí gametofyt, vysoce organizovaný haploidní květní orgán, nabízí jedinečnou příležitost sledovat vývoj a diferenciaci jediné haploidní buňky, dále mezibuněčné interakce, buněčnou polaritu a vrcholový růst pylové láčky. Posttranskripční regulace genovéexprese hraje zásadní roli během dozrávání pylu tabáku a při růstu pylové láčky. Řada skladovaných pylových mRNA je asociována s pylově specifickými ribonukleoproteinovými částicemi nově popsanými jako EPP komplexy. Podobně jako v rostoucích axonech savčích neuronů, EPP částice představují složitý aparát určený k uložení a transportu mRNA a k subcelulární lokalizaci syntézy bílkovin, translace. Cílem předkládaného projektu je podrobná funkční, transkriptomická a proteomická charakterizace pylových skladovaných RNP částic. Zejména se budeme snažit integrovat naše znalosti o translační regulaci v pylu a identifikovat a objasnit mód aktivity specifických bílkovin a/nebo malých RNA podílejících se na sekvestraci a následné aktivaci translace skladovanýchmRNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution brought fundamental new knowledge about the role of ribonucleoprotein particles in pollen development and function. In addition the pollen developmental translatome and sequestrome has been defined for the first time. Results were published in 7 papers in high standard journals (4 of them in journals with IF approx. 4-5).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 18, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
8,561 thou. CZK
Public financial support
8,561 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
8 561 CZK thou.
Public support
8 561 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
ED - Physiology
Solution period
01. 01. 2011 - 31. 12. 2014